Museum Tsunami ini menyimpan sekitar 416 koleksi. Koleksi tersebut dibagi ke dalam beberapa jenis, yaitu:

• koleksi etnografika,
• koleksi biologika,
• koleksi teknologika,
• koleksi keramonologika,
• koleksi seni rupa,
• koleksi numismatika,
• koleksi geologika,
• koleksi filologika, serta
• koleksi historika13